Lineage short_Lineage lefse_pValue lefse_LDA carcinoma normal logFC lefse_selected_feature Abiotrophia_defectiva Abiotrophia_defectiv 1 0 17 47 -1.415037499278844 N.S. Acetanaerobacterium_elongatum Acetanaerobacterium_ 0.0970595 2.39437 3818 1899 1.0071955014042029 N.S. Acetatifactor_muris Acetatifactor_muris 1 0 47 49 -0.05889368905356829 N.S. Acetitomaculum_ruminis Acetitomaculum_rumin 0.45492 -1.7742 239 2063 -3.1043366598147353 N.S. Acetivibrio_cellulolyticus Acetivibrio_cellulol 0.205904 -1.01438 9911 20748 -1.0657937147211456 N.S. Acetivibrio_ethanolgignens Acetivibrio_ethanolg 1 0 24793 12699 0.9651625422626271 N.S. Acidaminobacter_hydrogenoformans Acidaminobacter_hydr 1 0 0 217 -7.768184324776926 N.S. Acidaminococcus_intestini Acidaminococcus_inte 0.39495199999999997 -3.58596 1510 37506 -4.633584307935612 N.S. Acinetobacter_baumannii Acinetobacter_bauman 0.171839 -1.77039 899 1581 -0.8137526932557542 N.S. Actinobaculum_Species Actinobaculum_Specie 1 0 48 258 -2.4020984435713464 N.S. Actinomyces_dentalis Actinomyces_dentalis 1 0 0 70 -6.149747119504682 N.S. Actinomyces_graevenitzii Actinomyces_graeveni 1 0 89 193 -1.108059745857453 N.S. Actinomyces_johnsonii Actinomyces_johnsoni 0.492946 -0.697082 197 249 -0.3364276645824775 N.S. Actinomyces_odontolyticus Actinomyces_odontoly 1 0 2946 3168 -0.10478059925823224 N.S. Adlercreutzia_equolifaciens Adlercreutzia_equoli 0.32966599999999996 -2.70734 5205 10105 -0.9569648682138396 N.S. Aerococcus_viridans Aerococcus_viridans 1 0 5 6 -0.2223924213364481 N.S. Aestuariispira_insulae Aestuariispira_insul 1 0 321 604 -0.9098744540473387 N.S. Akkermansia_muciniphila Akkermansia_muciniph 0.191376 4.27127 311872 279201 0.15964938266622042 N.S. Alistipes_finegoldii Alistipes_finegoldii 1 0 24866 28197 -0.181360371492989 N.S. Alistipes_indistinctus Alistipes_indistinct 0.418635 -2.49684 7966 13929 -0.8060867779078613 N.S. Alistipes_onderdonkii Alistipes_onderdonki 0.30968999999999997 3.2563 59662 64861 -0.12053698784705347 N.S. Alistipes_shahii Alistipes_shahii 1 0 6319 20808 -1.7192111728842523 N.S. Alistipes_timonensis Alistipes_timonensis 1 0 92338 83260 0.14929922261186235 N.S. Alkalibacter_saccharofermentans Alkalibacter_sacchar 1 0 0 56 -5.832890014164741 N.S. Alkaliphilus_crotonatoxidans Alkaliphilus_crotona 1 0 11626 23186 -0.9958372716004664 N.S. Alkaliphilus_transvaalensis Alkaliphilus_transva 0.206499 -1.97765 1009 1951 -0.9505977599237294 N.S. Allisonella_histaminiformans Allisonella_histamin 0.00139074 -1.7731 0 693 -9.43879185257826 normal Allobaculum_stercoricanis Allobaculum_stercori 1 0 3 7 -1 N.S. Alloprevotella_rava Alloprevotella_rava 1 0 33 71 -1.082462160191973 N.S. Alloscardovia_omnicolens Alloscardovia_omnico 1 0 19 31 -0.6780719051126374 N.S. Anaerobacterium_chartisolvens Anaerobacterium_char 0.379561 1.60704 832 126 2.713487998593383 N.S. Anaerococcus_murdochii Anaerococcus_murdoch 1 0 14 0 3.9068905956085187 N.S. Anaerococcus_vaginalis Anaerococcus_vaginal 1 0 182 34 2.3864168213390764 N.S. Anaerofilum_agile Anaerofilum_agile 1 0 362 1544 -2.0895653847959856 N.S. Anaerofilum_pentosovorans Anaerofilum_pentosov 0.138429 -1.10954 82 308 -1.89642359655745 N.S. Anaerofustis_stercorihominis Anaerofustis_stercor 0.28396 -1.56443 63 300 -2.2336196767597016 N.S. Anaeroglobus_geminatus Anaeroglobus_geminat 1 0 0 5 -2.584962500721156 N.S. Anaeroplasma_bactoclasticum Anaeroplasma_bactocl 1 0 6 0 2.807354922057604 N.S. Anaerorhabdus_furcosa Anaerorhabdus_furcos 0.209622 1.82443 825 233 1.8196332518360414 N.S. Anaerosinus_glycerini Anaerosinus_glycerin 1 0 111 747 -2.7395395378300336 N.S. Anaerosporobacter_mobilis Anaerosporobacter_mo 1 0 2236 2372 -0.08514684413482954 N.S. Anaerostipes_butyraticus Anaerostipes_butyrat 0.216789 0.512559 22 14 0.6166713604484944 N.S. Anaerostipes_caccae Anaerostipes_caccae 0.451161 -1.20113 150 306 -1.0236901060451 N.S. Anaerostipes_hadrus Anaerostipes_hadrus 1 0 71129 66476 0.09760288646863202 N.S. Anaerostipes_rhamnosivorans Anaerostipes_rhamnos 1 0 246 499 -1.0174170530774092 N.S. Anaerotruncus_colihominis Anaerotruncus_coliho 1 0 1716 2388 -0.47651681445419847 N.S. Anaerovibrio_lipolyticus Anaerovibrio_lipolyt 1 0 149 61 1.2746223801090055 N.S. Anaerovorax_odorimutans Anaerovorax_odorimut 0.110295 -2.35843 3347 6492 -0.9555856814768333 N.S. Atopobium_rimae Atopobium_rimae 1 0 22 65 -1.5208321633014403 N.S. Bacillus_Species Bacillus_Species 0.38209699999999996 1.57865 1554 2202 -0.5025549146829178 N.S. Bacillus_thermocloacae Bacillus_thermocloac 1 0 0 155 -7.285402218862249 N.S. Bacteroides_caccae Bacteroides_caccae 0.30968999999999997 -3.91964 49579 155317 -1.6473948586349216 N.S. Bacteroides_cellulosilyticus Bacteroides_cellulos 0.191376 -3.20843 33801 62555 -0.8880396552153318 N.S. Bacteroides_clarus Bacteroides_clarus 0.110295 -3.70482 19128 75681 -1.9841887579693989 N.S. Bacteroides_coprocola Bacteroides_coprocol 0.468294 3.33235 15775 417 5.238084704297028 N.S. Bacteroides_coprophilus Bacteroides_coprophi 0.228438 -0.606026 32 2583 -6.290996235335471 N.S. Bacteroides_dorei Bacteroides_dorei 1 0 303849 363068 -0.2568844615668162 N.S. Bacteroides_eggerthii Bacteroides_eggerthi 5.34435e-4 -3.85745 1204 93532 -6.278370410082118 normal Bacteroides_fragilis Bacteroides_fragilis 1 0 96761 109655 -0.18047225929937838 N.S. Bacteroides_luti Bacteroides_luti 0.155022 -0.647161 8 27 -1.6374299206152916 N.S. Bacteroides_massiliensis Bacteroides_massilie 1 0 17691 22108 -0.3215366255359484 N.S. Bacteroides_nordii Bacteroides_nordii 1 0 69988 93011 -0.4102886633884175 N.S. Bacteroides_ovatus Bacteroides_ovatus 0.27172999999999997 3.60401 91625 83113 0.14066552896872508 N.S. Bacteroides_plebeius Bacteroides_plebeius 0.205904 2.7615 10738 2567 2.064142550349203 N.S. Bacteroides_Species Bacteroides_Species 1 0 98026 128686 -0.3926152426252081 N.S. Bacteroides_stercoris Bacteroides_stercori 0.44319499999999995 -3.86195 49097 95264 -0.9562820130268452 N.S. Bacteroides_uniformis Bacteroides_uniformi 0.443144 -3.91758 117007 227877 -0.9616544771307431 N.S. Bacteroides_xylanisolvens Bacteroides_xylaniso 1 0 275159 398832 -0.5355140245269396 N.S. Barnesiella_intestinihominis Barnesiella_intestin 0.30968999999999997 3.53822 69710 46241 0.5921825263489975 N.S. Barnesiella_viscericola Barnesiella_visceric 1 0 4420 1242 1.8305464379015817 N.S. Bifidobacterium_bifidum Bifidobacterium_bifi 1 0 1480 16642 -3.490271965565187 N.S. Bifidobacterium_Species Bifidobacterium_Spec 1 0 45787 102117 -1.1571957324779252 N.S. Bilophila_wadsworthia Bilophila_wadsworthi 1 0 14385 15229 -0.08225043260776133 N.S. Blautia_faecis Blautia_faecis 0.372594 3.29183 83053 46034 0.8513185056018546 N.S. Blautia_glucerasea Blautia_glucerasea 0.27172999999999997 4.18582 97432 3880 4.649910149400178 N.S. Blautia_hydrogenotrophica Blautia_hydrogenotro 1 0 3155 2792 0.17628163173350764 N.S. Blautia_luti Blautia_luti 0.468294 -2.31585 48181 69225 -0.5228197090589095 N.S. Blautia_schinkii Blautia_schinkii 0.0712069 3.69411 53360 13024 2.0345023307788814 N.S. Blautia_stercoris Blautia_stercoris 1 0 13300 8608 0.6276171423562751 N.S. Blautia_wexlerae Blautia_wexlerae 1 0 171368 147880 0.21266945055501196 N.S. Brassicibacter_mesophilus Brassicibacter_mesop 1 0 11 1966 -7.356818741557374 N.S. Brevibacterium_casei Brevibacterium_casei 1 0 0 27 -4.807354922057604 N.S. Bulleidia_extructa Bulleidia_extructa 1 0 82 0 6.3750394313469245 N.S. Buttiauxella_ferragutiae Buttiauxella_ferragu 0.0779243 2.88761 8827 811 3.4425349970944374 N.S. Butyricicoccus_pullicaecorum Butyricicoccus_pulli 1 0 10950 8897 0.2995096131561308 N.S. Butyricimonas_paravirosa Butyricimonas_paravi 0.34587599999999996 -1.5675 1585 4266 -1.4278293394971318 N.S. Butyricimonas_synergistica Butyricimonas_synerg 1 0 0 1635 -10.67595703294175 N.S. Butyricimonas_virosa Butyricimonas_virosa 1 0 0 46 -5.554588851677638 N.S. Butyrivibrio_Species Butyrivibrio_Species 1 0 3733 5265 -0.49598559381986007 N.S. Caldicellulosiruptor_owensensis Caldicellulosiruptor 1 0 619 1007 -0.7011555182256775 N.S. Caloramator_australicus Caloramator_australi 0.41246799999999995 -1.42822 41 218 -2.382469636822413 N.S. Caloramator_coolhaasii Caloramator_coolhaas 1 0 40 0 5.357552004618084 N.S. Caloramator_fervidus Caloramator_fervidus 0.47258 -1.29941 76 264 -1.7830620087556612 N.S. Caloramator_viterbiensis Caloramator_viterbie 1 0 37 32 0.20353339408513182 N.S. Campylobacter_concisus Campylobacter_concis 1 0 10 26 -1.295455883526171 N.S. Campylobacter_gracilis Campylobacter_gracil 1 0 33 6 2.280107919192735 N.S. Campylobacter_hominis Campylobacter_homini 1 0 5 36 -2.624490864907794 N.S. Campylobacter_ureolyticus Campylobacter_ureoly 1 0 1601 0 10.64565843240871 N.S. Catabacter_hongkongensis Catabacter_hongkonge 1 0 205 371 -0.8526582839248125 N.S. Catenibacterium_mitsuokai Catenibacterium_mits 0.46467899999999995 2.75761 3505 35 6.6056852793172265 N.S. Catenisphaera_adipataccumulans Catenisphaera_adipat 1 0 0 10 -3.4594316186372973 N.S. Cellulosibacter_alkalithermophilus Cellulosibacter_alka 0.347881 -2.55523 5199 8636 -0.7320186663687753 N.S. Cetobacterium_somerae Cetobacterium_somera 1 0 304 0 8.252665432450248 N.S. Christensenella_minuta Christensenella_minu 0.164572 -2.02928 505 1385 -1.4537179674429037 N.S. Cloacibacillus_evryensis Cloacibacillus_evrye 1 0 495 255 0.9541963103868749 N.S. Cloacibacillus_porcorum Cloacibacillus_porco 1 0 496 0 8.957102041562287 N.S. Clostridium_acetireducens Clostridium_acetired 0.0926756 1.69207 2523 1503 0.7469073433049118 N.S. Clostridium_aerotolerans Clostridium_aerotole 1 0 82 131 -0.6693546880115289 N.S. Clostridium_aldenense Clostridium_aldenens 0.0537976 2.24346 2944 1320 1.1566371674709952 N.S. Clostridium_amygdalinum Clostridium_amygdali 1 0 3127 9959 -1.6709052296480902 N.S. Clostridium_amylolyticum Clostridium_amylolyt 1 0 5 0 2.584962500721156 N.S. Clostridium_asparagiforme Clostridium_asparagi 0.021338700000000002 -2.16199 12043 19685 -0.7088553865148999 N.S. Clostridium_beijerinckii Clostridium_beijerin 0.372594 2.13197 3962 4787 -0.27283018497551836 N.S. Clostridium_bolteae Clostridium_bolteae 1 0 8809 4066 1.1151770283456433 N.S. Clostridium_cellobioparum Clostridium_cellobio 0.46809599999999996 2.67029 16365 13279 0.301446610354974 N.S. Clostridium_cellulolyticum Clostridium_cellulol 1 0 6 6 0 N.S. Clostridium_chartatabidum Clostridium_chartata 0.0363237 2.7542 4545 6 9.343027046760245 carcinoma Clostridium_citroniae Clostridium_citronia 1 0 3417 4143 -0.2778716060104145 N.S. Clostridium_cocleatum Clostridium_cocleatu 1 0 10746 29390 -1.4514404550543958 N.S. Clostridium_colinum Clostridium_colinum 1 0 673 121 2.465867443618972 N.S. Clostridium_disporicum Clostridium_disporic 1 0 44601 33954 0.39348437121801716 N.S. Clostridium_estertheticum_subsp_estertheticum Clostridium_esterthe 0.176353 0.579988 189 115 0.711874613203376 N.S. Clostridium_fimetarium Clostridium_fimetari 0.0107461 -2.69206 4473 11917 -1.413504991054518 normal Clostridium_glycyrrhizinilyticum Clostridium_glycyrrh 1 0 10836 6965 0.6375630535495347 N.S. Clostridium_hungatei Clostridium_hungatei 1 0 72 13 2.3824696368224134 N.S. Clostridium_hylemonae Clostridium_hylemona 1 0 28507 25138 0.1814395673000888 N.S. Clostridium_iii_Species Clostridium_iii_Spec 1 0 10142 15160 -0.579880492885918 N.S. Clostridium_indolis Clostridium_indolis 0.143422 -1.07192 110 326 -1.5587309591479768 N.S. Clostridium_lactatifermentans Clostridium_lactatif 0.0512277 3.15487 24909 7661 1.7009320907043186 N.S. Clostridium_leptum Clostridium_leptum 0.254032 -3.00372 8094 13457 -0.7333610406174991 N.S. Clostridium_limosum Clostridium_limosum 1 0 32 17 0.8744691179161412 N.S. Clostridium_methylpentosum Clostridium_methylpe 1 0 7129 8697 -0.2867816321328185 N.S. Clostridium_nexile Clostridium_nexile 1 0 4501 5507 -0.2909625026808076 N.S. Clostridium_papyrosolvens Clostridium_papyroso 0.0950759 -2.03383 82 925 -3.479828951913311 N.S. Clostridium_paraputrificum Clostridium_paraputr 1 0 160 548 -1.769745460890582 N.S. Clostridium_polysaccharolyticum Clostridium_polysacc 1 0 96 138 -0.5190282305363798 N.S. Clostridium_propionicum Clostridium_propioni 1 0 21 20 0.06711419585853662 N.S. Clostridium_purinilyticum Clostridium_purinily 1 0 446 961 -1.1057620625867237 N.S. Clostridium_ramosum Clostridium_ramosum 0.218244 -2.84089 2840 6587 -1.213441723536814 N.S. Clostridium_saccharolyticum Clostridium_saccharo 1 0 23 18 0.33703498727757086 N.S. Clostridium_scindens Clostridium_scindens 1 0 3510 3845 -0.13147676645914252 N.S. Clostridium_sensu_stricto_Species Clostridium_sensu_st 0.34696299999999997 1.8036 918 232 1.9797349066347554 N.S. Clostridium_sordellii Clostridium_sordelli 0.34587599999999996 -1.40684 127 303 -1.2479275134435852 N.S. Clostridium_spiroforme Clostridium_spirofor 0.00379153 -2.4587 252 4368 -4.110093815749908 normal Clostridium_sporosphaeroides Clostridium_sporosph 1 0 26509 23287 0.18694992563185586 N.S. Clostridium_stercorarium_subsp_thermolacticum Clostridium_stercora 1 0 0 8 -3.169925001442312 N.S. Clostridium_subterminale Clostridium_subtermi 1 0 6 70 -3.342392197447078 N.S. Clostridium_symbiosum Clostridium_symbiosu 0.426322 1.76925 1087 540 1.0079780574235233 N.S. Clostridium_viride Clostridium_viride 1 0 56982 21143 1.430283247539979 N.S. Clostridium_xlva_Species Clostridium_xlva_Spe 1 0 162 335 -1.0435892685476826 N.S. Clostridium_xylanovorans Clostridium_xylanovo 1 0 176 129 0.4452377370545433 N.S. Collinsella_aerofaciens Collinsella_aerofaci 1 0 53618 30892 0.7954643361709923 N.S. Collinsella_intestinalis Collinsella_intestin 1 0 291 68 2.0813001021018485 N.S. Collinsella_tanakaei Collinsella_tanakaei 1 0 243 2676 -3.45566408607789 N.S. Comamonas_kerstersii Comamonas_kerstersii 0.127646 -0.612436 17 27 -0.6374299206152916 N.S. Coprobacillus_cateniformis Coprobacillus_cateni 0.139263 -2.14357 117 1047 -3.1507799521756086 N.S. Coprobacter_fastidiosus Coprobacter_fastidio 0.221083 2.52905 6558 4784 0.45495695034340145 N.S. Coprococcus_comes Coprococcus_comes 1 0 22164 30263 -0.44931931899674815 N.S. Coprococcus_eutactus Coprococcus_eutactus 0.0537709 -4.11236 7611 75630 -3.3126302277649415 N.S. Coprococcus_Species Coprococcus_Species 1 0 4622 6938 -0.585898404121405 N.S. Corynebacterium_durum Corynebacterium_duru 0.31758099999999995 -0.782191 29 62 -1.070389327891398 N.S. Corynebacterium_matruchotii Corynebacterium_matr 1 0 16 0 4.087462841250339 N.S. Corynebacterium_tuberculostearicum Corynebacterium_tube 1 0 22 0 4.523561956057013 N.S. Defluviitalea_saccharophila Defluviitalea_saccha 1 0 255 463 -0.8579809951275728 N.S. Deinococcus_radiodurans Deinococcus_radiodur 1 0 2165 2900 -0.421517052589671 N.S. Dendrosporobacter_quercicolus Dendrosporobacter_qu 0.177672 -3.72788 4119 58456 -3.8266595497398566 N.S. Desulfitibacter_alkalitolerans Desulfitibacter_alka 1 0 230 228 0.012545253319113492 N.S. Desulfomicrobium_orale Desulfomicrobium_ora 1 0 4 2549 -8.994353436858859 N.S. Desulfotomaculum_alkaliphilum Desulfotomaculum_alk 0.224164 1.32126 152 21 2.797956224055355 N.S. Desulfotomaculum_intricatum Desulfotomaculum_int 1 0 50 55 -0.13492958008610856 N.S. Desulfovibrio_frigidus Desulfovibrio_frigid 1 0 18 10 0.7884958948062879 N.S. Desulfovibrio_intestinalis Desulfovibrio_intest 1 0 25 13 0.8930847960834876 N.S. Desulfovibrio_piger Desulfovibrio_piger 1 0 7190 1922 1.9028336470303913 N.S. Desulfovibrio_simplex Desulfovibrio_simple 1 0 771 590 0.3854427170905481 N.S. Desulfovibrio_Species Desulfovibrio_Specie 1 0 325 317 0.035845198946722334 N.S. Dethiobacter_alkaliphilus Dethiobacter_alkalip 1 0 943 772 0.2883184454369925 N.S. Dialister_invisus Dialister_invisus 0.350956 -3.50247 10882 58941 -2.4372197106366933 N.S. Dialister_pneumosintes Dialister_pneumosint 1 0 1175 85 3.7734075901342656 N.S. Dialister_succinatiphilus Dialister_succinatip 0.300647 -2.69262 4726 7897 -0.7405625031016978 N.S. Dietzia_maris Dietzia_maris 1 0 6 7 -0.19264507794239583 N.S. Dorea_formicigenerans Dorea_formicigeneran 0.205854 2.38581 10642 6416 0.7299339800845832 N.S. Dorea_longicatena Dorea_longicatena 0.10136200000000001 2.56788 34118 19680 0.7937718365739403 N.S. Eggerthella_lenta Eggerthella_lenta 1 0 3040 1499 1.0195833156475551 N.S. Eggerthia_catenaformis Eggerthia_catenaform 0.161586 -1.12779 44 260 -2.53605290024021 N.S. Eikenella_corrodens Eikenella_corrodens 0.014503499999999999 0.648982 52 10 2.2684888359259014 carcinoma Eisenbergiella_tayi Eisenbergiella_tayi 1 0 16 21 -0.3719687773869582 N.S. Enterococcus_alcedinis Enterococcus_alcedin 0.07185470000000001 -3.71406 2475 22512 -3.1846750981995537 N.S. Enterococcus_hermanniensis Enterococcus_hermann 1 0 1204 8082 -2.7458577012050434 N.S. Enterorhabdus_mucosicola Enterorhabdus_mucosi 0.471514 -2.17277 1472 4231 -1.5225821970781777 N.S. Escherichia_coli Escherichia_coli 0.164759 4.18381 212682 45067 2.238529388058655 N.S. Ethanoligenens_harbinense Ethanoligenens_harbi 0.0889503 -2.12163 838 6792 -3.0173061384085393 N.S. Eubacterium_callanderi Eubacterium_callande 1 0 182 3462 -4.242106833913185 N.S. Eubacterium_coprostanoligenes Eubacterium_coprosta 0.0851907 -3.89466 29731 143200 -2.267953149011454 N.S. Eubacterium_desmolans Eubacterium_desmolan 1 0 3226 3329 -0.04532859947168255 N.S. Eubacterium_dolichum Eubacterium_dolichum 1 0 2847 1239 1.19960902569216 N.S. Eubacterium_eligens Eubacterium_eligens 1 0 10739 22719 -1.0809688415192706 N.S. Eubacterium_hallii Eubacterium_hallii 0.32971999999999996 3.65861 82876 57950 0.5161382244440169 N.S. Eubacterium_infirmum Eubacterium_infirmum 0.0488365 -2.11235 870 2206 -1.3413420056807492 normal Eubacterium_rectale Eubacterium_rectale 1 0 8 8 0 N.S. Eubacterium_ruminantium Eubacterium_ruminant 0.48077299999999995 -3.23317 6989 26438 -1.919303250234977 N.S. Eubacterium_siraeum Eubacterium_siraeum 1 0 4753 39481 -3.053981264405362 N.S. Eubacterium_sulci Eubacterium_sulci 0.309152 2.58441 4122 888 2.2134391370582964 N.S. Eubacterium_tortuosum Eubacterium_tortuosu 1 0 516 1067 -1.0466754613726206 N.S. Eubacterium_ventriosum Eubacterium_ventrios 0.0712069 2.52896 4347 4453 -0.03474961776048069 N.S. Eubacterium_xylanophilum Eubacterium_xylanoph 0.468294 2.50549 10290 11291 -0.13391785488083663 N.S. Ezakiella_peruensis Ezakiella_peruensis 1 0 11 10 0.12553088208385876 N.S. Faecalibacterium_prausnitzii Faecalibacterium_pra 1 0 189372 287577 -0.6027226602863927 N.S. Faecalicoccus_acidiformans Faecalicoccus_acidif 1 0 358 84 2.0784490976853496 N.S. Faecalicoccus_pleomorphus Faecalicoccus_pleomo 1 0 0 12 -3.700439718141092 N.S. Faecalitalea_cylindroides Faecalitalea_cylindr 1 0 394 214 0.8775159934750052 N.S. Falsiporphyromonas_endometrii Falsiporphyromonas_e 0.206499 -0.692017 8 16 -0.917537839808027 N.S. Filifactor_Species Filifactor_Species 1 0 3 0 2 N.S. Filifactor_villosus Filifactor_villosus 1 0 120 23 2.3339007365534385 N.S. Finegoldia_magna Finegoldia_magna 1 0 38 16 1.1979393776119096 N.S. Flaviflexus_salsibiostraticola Flaviflexus_salsibio 1 0 0 9 -3.321928094887362 N.S. Flavonifractor_plautii Flavonifractor_plaut 0.395163 2.46634 10970 12570 -0.19640438555540918 N.S. Fusibacter_bizertensis Fusibacter_bizertens 1 0 18 125 -2.7293524100563316 N.S. Fusicatenibacter_saccharivorans Fusicatenibacter_sac 1 0 51749 44101 0.2307147799662328 N.S. Fusobacterium_mortiferum Fusobacterium_mortif 0.0025741600000000003 4.70844 527625 3754 7.134558940534511 carcinoma Fusobacterium_necrophorum_subsp_funduliforme Fusobacterium_necrop 1 0 4117 0 12.007728114632254 N.S. Fusobacterium_nucleatum_subsp_animalis Fusobacterium_nuclea 0.011881599999999999 2.83097 5614 44 6.963217210958288 carcinoma Gemella_sanguinis Gemella_sanguinis 1 0 716 243 1.5550919711390172 N.S. Gemmiger_formicilis Gemmiger_formicilis 1 0 84005 77923 0.10842463801724378 N.S. Geosporobacter_subterraneus Geosporobacter_subte 0.0442771 -3.90425 164 83006 -8.97462316970843 normal Gordonibacter_faecihominis Gordonibacter_faecih 1 0 268 475 -0.8233554007513195 N.S. Gordonibacter_pamelaeae Gordonibacter_pamela 1 0 0 38 -5.285402218862249 N.S. Gordonibacter_urolithinfaciens Gordonibacter_urolit 1 0 7 0 3 N.S. Gp5_Species Gp5_Species 1 0 0 14 -3.9068905956085187 N.S. Gpiia_Species Gpiia_Species 1 0 1332 0 10.380461065088973 N.S. Gracilibacter_thermotolerans Gracilibacter_thermo 0.16212000000000001 -1.84035 596 1278 -1.0992134276168315 N.S. Guggenheimella_bovis Guggenheimella_bovis 1 0 0 2239 -11.129283016944967 N.S. Haemophilus_parainfluenzae Haemophilus_parainfl 0.220105 -3.03137 4790 15865 -1.7275397355169186 N.S. Haemophilus_pittmaniae Haemophilus_pittmani 0.156136 -0.69917 21 49 -1.184424571137427 N.S. Helicobacter_pylori Helicobacter_pylori 1 0 15 81 -2.357552004618084 N.S. Hespellia_porcina Hespellia_porcina 1 0 1690 1737 -0.03955142240441667 N.S. Hespellia_stercorisuis Hespellia_stercorisu 1 0 0 10248 -13.323195531678138 N.S. Holdemanella_biformis Holdemanella_biformi 6.35076e-5 -3.01733 5 16194 -11.398298346961393 normal Holdemania_filiformis Holdemania_filiformi 1 0 1033 1202 -0.21840045686114173 N.S. Howardella_ureilytica Howardella_ureilytic 0.467302 -2.0856 1288 2167 -0.7501124929922192 N.S. Hungatella_effluvii Hungatella_effluvii 1 0 12557 11506 0.12609496121731212 N.S. Hungatella_hathewayi Hungatella_hathewayi 0.14091 -3.18167 26197 89371 -1.770366231671714 N.S. Hydrogenibacillus_schlegelii Hydrogenibacillus_sc 1 0 59 5 3.3219280948873626 N.S. Hydrogenispora_ethanolica Hydrogenispora_ethan 1 0 40 171 -2.068712750084014 N.S. Hydrogenoanaerobacterium_saccharovorans Hydrogenoanaerobacte 1 0 419 355 0.2385120866997248 N.S. Insolitispirillum_peregrinum_subsp_integrum Insolitispirillum_pe 1 0 0 8451 -13.04507705193494 N.S. Intestinibacter_bartlettii Intestinibacter_bart 0.49390999999999996 -3.13998 36470 33140 0.1381326222897883 N.S. Intestinimonas_butyriciproducens Intestinimonas_butyr 1 0 8075 10143 -0.3289138348079348 N.S. Jeotgalicoccus_nanhaiensis Jeotgalicoccus_nanha 1 0 0 9 -3.321928094887362 N.S. Jonquetella_anthropi Jonquetella_anthropi 1 0 0 983 -9.94251450533924 N.S. Lachnoanaerobaculum_orale Lachnoanaerobaculum_ 1 0 5 0 2.584962500721156 N.S. Lachnobacterium_bovis Lachnobacterium_bovi 0.0779574 -3.3537 7048 50533 -2.8417638699508316 N.S. Lachnospira_multipara Lachnospira_multipar 0.108908 0.903961 151 182 -0.26777232484045754 N.S. Lachnospiracea_incertae_sedis_Species Lachnospiracea_incer 1 0 5534 4577 0.27386585411322706 N.S. Lactivibrio_alcoholicus Lactivibrio_alcoholi 1 0 139 174 -0.3219280948873626 N.S. Lactobacillus_acidophilus Lactobacillus_acidop 1 0 0 88 -6.475733430966398 N.S. Lactobacillus_faecis Lactobacillus_faecis 0.271196 1.32384 394 222 0.824808943144161 N.S. Lactobacillus_fermentum Lactobacillus_fermen 1 0 20 56 -1.4405725913859806 N.S. Lactobacillus_hominis Lactobacillus_homini 0.308612 1.83443 1094 651 0.7479870002574582 N.S. Lactobacillus_mucosae Lactobacillus_mucosa 1 0 0 14 -3.9068905956085187 N.S. Lactobacillus_oris Lactobacillus_oris 1 0 65 63 0.04439411935845339 N.S. Lactobacillus_sakei_subsp_carnosus Lactobacillus_sakei_ 0.45993999999999996 1.78236 528 154 1.7709995068397886 N.S. Lactobacillus_sanfranciscensis Lactobacillus_sanfra 1 0 0 7 -3 N.S. Lactobacillus_Species Lactobacillus_Specie 1 0 0 58 -5.882643049361842 N.S. Lactococcus_taiwanensis Lactococcus_taiwanen 1 0 691 1684 -1.283904648432495 N.S. Lactonifactor_longoviformis Lactonifactor_longov 0.350956 3.53175 33100 5792 2.5144922322046472 N.S. Leuconostoc_carnosum Leuconostoc_carnosum 1 0 50 44 0.1805722456418204 N.S. Leuconostoc_lactis Leuconostoc_lactis 1 0 36 0 5.20945336562895 N.S. Listeria_innocua Listeria_innocua 0.41237799999999997 1.60616 1018 1368 -0.4259683950920863 N.S. Lutispora_thermophila Lutispora_thermophil 1 0 1767 1262 0.48526363560387864 N.S. Marinococcus_halophilus Marinococcus_halophi 1 0 38 46 -0.2691866328153889 N.S. Marvinbryantia_formatexigens Marvinbryantia_forma 0.180376 0.896718 133 68 0.9575647336796029 N.S. Megasphaera_indica Megasphaera_indica 0.08014690000000001 -3.06087 14 6672 -8.7972291929045 N.S. Megasphaera_micronuciformis Megasphaera_micronuc 5.555170000000001e-4 -1.01734 0 66 -6.066089190457772 normal Melghirimyces_thermohalophilus Melghirimyces_thermo 0.45706699999999995 -1.52893 304 732 -1.2650039556835626 N.S. Mesoplasma_corruscae Mesoplasma_corruscae 1 0 0 7 -3 N.S. Methanobrevibacter_smithii Methanobrevibacter_s 0.26273799999999997 3.49736 86926 37674 1.2061968437667119 N.S. Methanosphaera_stadtmanae Methanosphaera_stadt 1 0 5 0 2.584962500721156 N.S. Micrococcus_endophyticus Micrococcus_endophyt 1 0 19 16 0.23446525363702353 N.S. Mobiluncus_curtisii_subsp_holmesii Mobiluncus_curtisii_ 1 0 0 31 -5 N.S. Mogibacterium_neglectum Mogibacterium_neglec 1 0 1302 954 0.4482644456450231 N.S. Mogibacterium_pumilum Mogibacterium_pumilu 0.35683099999999995 -1.58141 165 437 -1.3997476282542491 N.S. Mogibacterium_timidum Mogibacterium_timidu 0.12456 1.55752 688 721 -0.06749485418287904 N.S. Morganella_morganii_subsp_morganii Morganella_morganii_ 0.44413199999999997 1.13963 160 17 3.1609918766723046 N.S. Moryella_indoligenes Moryella_indoligenes 1 0 10 9 0.13750352374993513 N.S. Murdochiella_asaccharolytica Murdochiella_asaccha 1 0 0 20 -4.392317422778761 N.S. Murimonas_intestini Murimonas_intestini 1 0 22 16 0.43609911480667396 N.S. Natranaerovirga_hydrolytica_Species Natranaerovirga_hydr 0.122951 -1.91805 151 920 -2.599129832647751 N.S. Natranaerovirga_pectinivora_Species Natranaerovirga_pect 0.212922 -2.09464 305 6091 -4.315312383794641 N.S. Neisseria_Species Neisseria_Species 0.428874 -1.92804 1214 2129 -0.809897116620057 N.S. Nitrosomonas_eutropha Nitrosomonas_eutroph 0.22281600000000001 -0.806871 8 4932 -9.09832457055218 N.S. Obesumbacterium_proteus Obesumbacterium_prot 1 0 750 551 0.4441446407361038 N.S. Odoribacter_laneus Odoribacter_laneus 1 0 1099 28 5.24530681328445 N.S. Odoribacter_splanchnicus Odoribacter_splanchn 0.245577 -3.05436 8001 22633 -1.5000590340261581 N.S. Olsenella_profusa Olsenella_profusa 1 0 364 777 -1.0918736912188134 N.S. Oribacterium_asaccharolyticum Oribacterium_asaccha 1 0 10 12 -0.24100809950379487 N.S. Oribacterium_sinus Oribacterium_sinus 0.442177 -2.03215 543 2352 -2.112822763973959 N.S. Oscillibacter_ruminantium Oscillibacter_rumina 1 0 66034 79103 -0.26051976111844866 N.S. Oxalobacter_formigenes Oxalobacter_formigen 1 0 481 368 0.3854123301695651 N.S. Oxobacter_pfennigii Oxobacter_pfennigii 0.119419 -0.811847 171 453 -1.4002837325888162 N.S. Paenibacillus_harenae Paenibacillus_harena 1 0 59 87 -0.5525410230287786 N.S. Papillibacter_cinnamivorans Papillibacter_cinnam 1 0 1262 611 1.0452510810949018 N.S. Parabacteroides_chartae Parabacteroides_char 0.09770960000000001 -2.06977 5 913 -7.251087854336914 N.S. Parabacteroides_chinchillae Parabacteroides_chin 1 0 5328 1658 1.6835509468041714 N.S. Parabacteroides_distasonis Parabacteroides_dist 0.221135 2.89524 13647 7897 0.7891302788579431 N.S. Parabacteroides_faecis Parabacteroides_faec 1 0 1212 3607 -1.5726197881348707 N.S. Parabacteroides_goldsteinii Parabacteroides_gold 0.085156 -2.33264 1284 4013 -1.6432722572813763 N.S. Parabacteroides_merdae Parabacteroides_merd 1 0 51830 109912 -1.0844748979573122 N.S. Paraeggerthella_hongkongensis Paraeggerthella_hong 0.0476152 0.753135 2525 646 1.9650170217950453 carcinoma Parapedobacter_indicus Parapedobacter_indic 1 0 18 238 -3.6529392945371635 N.S. Paraprevotella_clara Paraprevotella_clara 0.0456608 2.8917 46884 51 9.816399094021637 carcinoma Paraprevotella_xylaniphila Paraprevotella_xylan 1 0 6 0 2.807354922057604 N.S. Parascardovia_denticolens Parascardovia_dentic 1 0 24 23 0.05889368905356829 N.S. Parasutterella_excrementihominis Parasutterella_excre 0.236182 -2.87969 15741 35086 -1.1563177550973673 N.S. Parasutterella_secunda Parasutterella_secun 1 0 150 717 -2.2494352944979727 N.S. Parvibacter_caecicola Parvibacter_caecicol 0.33107899999999996 -2.66237 279 3037 -3.439623137557117 N.S. Parvimonas_micra Parvimonas_micra 0.0282166 2.71972 4590 50 6.4921673747408715 carcinoma Pedobacter_arcticus Pedobacter_arcticus 1 0 0 177 -7.475733430966398 N.S. Pedobacter_nutrimenti Pedobacter_nutriment 1 0 12 9 0.37851162325373 N.S. Peptococcus_niger Peptococcus_niger 0.25105799999999995 2.24698 1605 156 3.354635428625687 N.S. Peptoniphilus_harei Peptoniphilus_harei 1 0 602 65 3.191620072541631 N.S. Peptostreptococcus_anaerobius Peptostreptococcus_a 1 0 119 40 1.549338590990435 N.S. Phascolarctobacterium_faecium Phascolarctobacteriu 0.191376 3.62637 108504 103221 0.07201103552775123 N.S. Phascolarctobacterium_succinatutens Phascolarctobacteriu 1 0 26413 10821 1.2873356459161123 N.S. Porphyromonas_asaccharolytica Porphyromonas_asacch 0.00723808 3.96901 78487 345 7.825556249689452 carcinoma Porphyromonas_bennonis Porphyromonas_bennon 0.09770960000000001 -1.69385 27 311 -3.478047296804645 N.S. Porphyromonas_canoris Porphyromonas_canori 1 0 49 0 5.643856189774724 N.S. Porphyromonas_catoniae Porphyromonas_catoni 1 0 9 10 -0.13750352374993513 N.S. Porphyromonas_endodontalis Porphyromonas_endodo 1 0 0 4 -2.321928094887362 N.S. Porphyromonas_gingivalis Porphyromonas_gingiv 0.29079 1.25936 521 759 -0.541949611761062 N.S. Porphyromonas_somerae Porphyromonas_somera 1 0 5553 43 6.979879843181549 N.S. Porphyromonas_uenonis Porphyromonas_uenoni 1 0 316 141 1.1585919106347253 N.S. Prevotella_baroniae Prevotella_baroniae 1 0 36 79 -1.1124747292584125 N.S. Prevotella_bergensis Prevotella_bergensis 1 0 25 0 4.700439718141092 N.S. Prevotella_bivia Prevotella_bivia 1 0 504 52 3.2522191230759585 N.S. Prevotella_bryantii Prevotella_bryantii 1 0 6919 14 8.849665726915568 N.S. Prevotella_buccae Prevotella_buccae 0.130461 1.80111 8762 405 4.431873226365159 N.S. Prevotella_buccalis Prevotella_buccalis 1 0 192 224 -0.22132415394895677 N.S. Prevotella_copri Prevotella_copri 1 0 59164 153657 -1.3769069968635126 N.S. Prevotella_corporis Prevotella_corporis 1 0 374 401 -0.10030490579568507 N.S. Prevotella_dentalis Prevotella_dentalis 1 0 31 0 5 N.S. Prevotella_denticola Prevotella_denticola 0.00195668 1.08848 112055 95 10.188897873242189 carcinoma Prevotella_disiens Prevotella_disiens 1 0 72 0 6.189824558880018 N.S. Prevotella_oris Prevotella_oris 1 0 64 0 6.022367813028454 N.S. Prevotella_stercorea Prevotella_stercorea 1 0 40 0 5.357552004618084 N.S. Prevotella_timonensis Prevotella_timonensi 1 0 376 285 0.39854937649027455 N.S. Propionibacterium_acnes Propionibacterium_ac 1 0 92 188 -1.0230836131130419 N.S. Proteinivorax_tanatarense Proteinivorax_tanata 1 0 22 208 -3.1837971760238695 N.S. Proteus_hauseri Proteus_hauseri 0.240117 0.663787 48 11 2.0297473433940523 N.S. Pseudobutyrivibrio_ruminis Pseudobutyrivibrio_r 0.455422 -2.20989 471 2444 -2.372975700477756 N.S. Pseudoflavonifractor_capillosus Pseudoflavonifractor 1 0 3409 4323 -0.3425947838231149 N.S. Pseudomonas_aeruginosa Pseudomonas_aerugino 1 0 706 1297 -0.8765082631897396 N.S. Pseudomonas_lundensis Pseudomonas_lundensi 1 0 228 304 -0.4134616443533048 N.S. Pseudomonas_Species Pseudomonas_Species 1 0 394 381 0.048280015028717926 N.S. Pseudoteredinibacter_isoporae Pseudoteredinibacter 1 0 0 2007 -10.971543553950772 N.S. Rhodobacter_sphaeroides Rhodobacter_sphaeroi 0.134052 -1.47927 432 766 -0.8248595527762088 N.S. Rikenella_microfusus Rikenella_microfusus 1 0 12 7 0.7004397181410922 N.S. Robinsoniella_peoriensis Robinsoniella_peorie 0.174961 -3.38798 2820 19684 -2.8028181414608326 N.S. Romboutsia_sedimentorum Romboutsia_sedimento 1 0 23387 21092 0.1490041961143902 N.S. Roseburia_faecis Roseburia_faecis 0.372594 3.55912 174326 151162 0.20569097741296716 N.S. Roseburia_hominis Roseburia_hominis 0.205904 -3.24026 16621 39185 -1.2372443329062541 N.S. Roseburia_intestinalis Roseburia_intestinal 0.30968999999999997 -2.7666 2296 7955 -1.7922924194558192 N.S. Roseburia_inulinivorans Roseburia_inulinivor 1 0 12275 18501 -0.5918406784259567 N.S. Rothia_dentocariosa Rothia_dentocariosa 0.258439 -0.5062 40 80 -0.9822979982665405 N.S. Rothia_mucilaginosa Rothia_mucilaginosa 0.214908 1.10099 378 210 0.8449548494639068 N.S. Ruminococcus_albus Ruminococcus_albus 1 0 314 277 0.18026694566377266 N.S. Ruminococcus_bromii Ruminococcus_bromii 0.152507 -3.32294 53682 118981 -1.1482061323330157 N.S. Ruminococcus_callidus Ruminococcus_callidu 1 0 14947 13164 0.183244947447319 N.S. Ruminococcus_champanellensis Ruminococcus_champan 1 0 34766 29982 0.21357384231372123 N.S. Ruminococcus_faecis Ruminococcus_faecis 1 0 62676 88911 -0.5044420177395832 N.S. Ruminococcus_flavefaciens Ruminococcus_flavefa 1 0 4620 7305 -0.6608766641954826 N.S. Ruminococcus_gnavus Ruminococcus_gnavus 0.350956 3.39634 48034 26271 0.8705599553968 N.S. Ruminococcus_lactaris Ruminococcus_lactari 0.0712069 4.0576 96986 42758 1.18156327015663 N.S. Ruminococcus_obeum Ruminococcus_obeum 1 0 89817 48812 0.8797391765166704 N.S. Ruminococcus_torques Ruminococcus_torques 0.44319499999999995 2.64921 28300 27756 0.028001382136219277 N.S. Saccharibacteria_genera_incertae_sedis_Species Saccharibacteria_gen 1 0 36 41 -0.18286405714981058 N.S. Sarcina_ventriculi Sarcina_ventriculi 1 0 25 16 0.6129768768907526 N.S. Scardovia_wiggsiae Scardovia_wiggsiae 1 0 17 31 -0.8300749985576878 N.S. Sedimentibacter_hydroxybenzoicus Sedimentibacter_hydr 1 0 0 5 -2.584962500721156 N.S. Selenomonas_noxia Selenomonas_noxia 1 0 400 5 6.062495925733764 N.S. Senegalimassilia_anaerobia Senegalimassilia_ana 1 0 518 1042 -1.0069327141618842 N.S. Slackia_heliotrinireducens Slackia_heliotrinire 1 0 0 3808 -11.89519657256334 N.S. Slackia_isoflavoniconvertens Slackia_isoflavonico 1 0 1033 5034 -2.2837555925792135 N.S. Slackia_piriformis Slackia_piriformis 1 0 0 32 -5.044394119358453 N.S. Solobacterium_moorei Solobacterium_moorei 1 0 236 17 3.718818247455947 N.S. Spiroplasma_chinense Spiroplasma_chinense 0.0439581 -3.15581 1403 10572 -2.912769946659493 normal Sporobacter_termitidis Sporobacter_termitid 1 0 15256 18724 -0.29549440727257625 N.S. Staphylococcus_Species Staphylococcus_Speci 0.057575100000000004 1.93244 3210 4284 -0.41627253927409136 N.S. Stomatobaculum_longum Stomatobaculum_longu 1 0 18 0 4.247927513443585 N.S. Streptococcus_agalactiae Streptococcus_agalac 1 0 857 891 -0.05606606242075962 N.S. Streptococcus_anginosus_subsp_whileyi Streptococcus_angino 1 0 2127 1491 0.5122506152459518 N.S. Streptococcus_dentirousetti Streptococcus_dentir 1 0 12 23 -0.8845227825800639 N.S. Streptococcus_infantarius_subsp_infantarius Streptococcus_infant 0.10136200000000001 -0.860078 1247 1143 0.12553088208385965 N.S. Streptococcus_lactarius Streptococcus_lactar 0.130043 0.964099 4927 4104 0.263620034029735 N.S. Streptococcus_mutans Streptococcus_mutans 0.253503 -1.46858 1068 1536 -0.5238553119702818 N.S. Streptococcus_salivarius_subsp_salivarius Streptococcus_saliva 0.164759 -1.08918 42673 40988 0.05812055301976038 N.S. Streptomyces_Species Streptomyces_Species 1 0 18 10 0.7884958948062879 N.S. Streptophyta_Species Streptophyta_Species 0.0761052 -1.07666 281 1258 -2.158511215320223 N.S. Subdoligranulum_variabile Subdoligranulum_vari 1 0 12514 9042 0.46878492221940604 N.S. Succiniclasticum_ruminis Succiniclasticum_rum 1 0 3262 109 4.890623558567205 N.S. Succinivibrio_dextrinosolvens Succinivibrio_dextri 1 0 11 6 0.7776075786635519 N.S. Sutterella_stercoricanis Sutterella_stercoric 1 0 140 214 -0.6086414971906668 N.S. Sutterella_wadsworthensis Sutterella_wadsworth 1 0 1313 303 2.1118220468787445 N.S. Syntrophococcus_sucromutans Syntrophococcus_sucr 0.00173676 1.4534 293 68 2.0911478880581944 carcinoma Terrisporobacter_glycolicus Terrisporobacter_gly 0.110256 -3.55978 1528 33620 -4.458702323934212 N.S. Tindallia_texcoconensis Tindallia_texcoconen 0.101232 -1.12441 8 102 -3.5165755257409064 N.S. Tissierella_Species Tissierella_Species 1 0 0 68 -6.108524456778169 N.S. Turicibacter_sanguinis Turicibacter_sanguin 1 0 3445 12966 -1.9118501346142356 N.S. Vallitalea_guaymasensis_Species Vallitalea_guaymasen 0.262785 -2.44034 411 2672 -2.69774359505986 N.S. Vallitalea_pronyensis_Species Vallitalea_pronyensi 0.127646 -2.56629 3627 15888 -2.1307819682108757 N.S. Vampirovibrio_chlorellavorus Vampirovibrio_chlore 1 0 1985 135 3.8681870662780344 N.S. Varibaculum_cambriense Varibaculum_cambrien 1 0 0 99 -6.643856189774724 N.S. Variovorax_ginsengisoli Variovorax_ginsengis 1 0 54 26 1.0264722113611917 N.S. Veillonella_dispar Veillonella_dispar 0.14091 -2.91391 1401 16382 -3.546641308184796 N.S. Veillonella_ratti Veillonella_ratti 1 0 34 27 0.3219280948873626 N.S. Veillonella_rogosae Veillonella_rogosae 1 0 0 12 -3.700439718141092 N.S. Weissella_hellenica Weissella_hellenica 1 0 16 310 -4.193307928880264 N.S.