Lineage	short_Lineage	lefse_pValue	lefse_LDA	carcinoma	normal	logFC	lefse_selected_feature
Abiotrophia	Abiotrophia	1	0	22	30	-0.43063435432986186	N.S.
Acetanaerobacterium	Acetanaerobacterium	1	0	13473	11528	0.22491082220332181	N.S.
Acetatifactor	Acetatifactor	1	0	279	194	0.5219527031953568	N.S.
Acetitomaculum	Acetitomaculum	1	0	951	9519	-3.3219280948873635	N.S.
Acetivibrio	Acetivibrio	0.30968999999999997	0	104517	91141	0.19756348919778688	N.S.
Acholeplasma	Acholeplasma	1	0	0	857	-9.744833837499545	N.S.
Acidaminobacter	Acidaminobacter	1	0	21	215	-3.295455883526171	N.S.
Acidaminococcus	Acidaminococcus	0.299766	-3.47387	3767	92883	-4.6235592323716705	N.S.
Acinetobacter	Acinetobacter	0.058435100000000004	-1.11072	2156	3350	-0.6355655100440174	N.S.
Actinobaculum	Actinobaculum	0.32434999999999997	-0.918694	48	260	-2.4131961524546766	N.S.
Actinomyces	Actinomyces	0.254032	1.54953	22132	20986	0.07670305894005836	N.S.
Adlercreutzia	Adlercreutzia	1	0	1543	4669	-1.596749797328945	N.S.
Aerococcus	Aerococcus	1	0	0	3	-2	N.S.
Aestuariispira	Aestuariispira	1	0	311	607	-0.9625252945813365	N.S.
Akkermansia	Akkermansia	0.468294	-3.96161	417831	443982	-0.08758145059718814	N.S.
Alistipes	Alistipes	0.21333	0	500240	732263	-0.5497405645840452	N.S.
Alkalibacter	Alkalibacter	1	0	108	267	-1.297904865680846	N.S.
Alkaliphilus	Alkaliphilus	1	0	50016	179400	-1.8426974990681124	N.S.
Allisonella	Allisonella	1	0	0	1995	-10.96289600533726	N.S.
Allobaculum	Allobaculum	1	0	0	553	-9.113742166049189	N.S.
Alloprevotella	Alloprevotella	1	0	8817	104	6.391990243949626	N.S.
Alloscardovia	Alloscardovia	1	0	20	26	-0.36257007938470753	N.S.
Anaerobacterium	Anaerobacterium	1	0	688	366	0.9087239198610781	N.S.
Anaerococcus	Anaerococcus	1	0	53	34	0.6256044852185019	N.S.
Anaerofilum	Anaerofilum	0.101324	-1.587	3525	16558	-2.231511171170233	N.S.
Anaerofustis	Anaerofustis	0.34463699999999997	-1.05986	96	459	-2.245577208757248	N.S.
Anaeroglobus	Anaeroglobus	1	0	7	0	3	N.S.
Anaeroplasma	Anaeroplasma	1	0	4	0	2.321928094887362	N.S.
Anaerorhabdus	Anaerorhabdus	1	0	174	246	-0.49715611975234886	N.S.
Anaerosinus	Anaerosinus	1	0	127	745	-2.543031820255237	N.S.
Anaerosporobacter	Anaerosporobacter	1	0	2622	2548	0.04128643424278344	N.S.
Anaerostipes	Anaerostipes	0.0939693	-0.788688	136610	149003	-0.12527740525701248	N.S.
Anaerotruncus	Anaerotruncus	0.237228	-1.69731	2501	4439	-0.8274778870716482	N.S.
Anaerovibrio	Anaerovibrio	1	0	48	62	-0.3625700793847084	N.S.
Anaerovorax	Anaerovorax	0.191376	-2.11791	7981	13349	-0.7420175579510069	N.S.
Asaccharobacter	Asaccharobacter	1	0	2025	5552	-1.4546332217905924	N.S.
Atopobium	Atopobium	1	0	176	195	-0.1471042940322107	N.S.
Bacillus	Bacillus	0.176706	1.69418	4525	5843	-0.3687195935366052	N.S.
Bacteroides	Bacteroides	1.74978e-4	3.2562	6575832	11380894	-0.791368450574911	N.S.
Barnesiella	Barnesiella	0.30968999999999997	3.31493	308601	254319	0.2791024902252772	N.S.
Bifidobacterium	Bifidobacterium	0.48077299999999995	0	207307	577520	-1.4780976161989159	N.S.
Bilophila	Bilophila	1	0	36606	41784	-0.19086558845389767	N.S.
Blautia	Blautia	0.0712069	3.91313	2596885	1954310	0.41012261354303803	N.S.
Brassicibacter	Brassicibacter	1	0	3821	23413	-2.6149717391552514	N.S.
Brevibacterium	Brevibacterium	1	0	0	25	-4.700439718141092	N.S.
Brumimicrobium	Brumimicrobium	1	0	0	472	-8.885696373339394	N.S.
Bulleidia	Bulleidia	1	0	187	0	7.554588851677638	N.S.
Buttiauxella	Buttiauxella	0.048736	2.38703	17361	1262	3.781006603076859	carcinoma
Butyricicoccus	Butyricicoccus	1	0	25461	46945	-0.8826564942138297	N.S.
Butyricimonas	Butyricimonas	0.39134899999999995	0	21688	58433	-1.4298445127137533	N.S.
Butyrivibrio	Butyrivibrio	0.418687	1.51159	14184	18475	-0.38128630068731617	N.S.
Caldicellulosiruptor	Caldicellulosiruptor	1	0	651	1002	-0.6213777363811044	N.S.
Caloramator	Caloramator	0.406964	0	3916	5733	-0.5497927762897774	N.S.
Campylobacter	Campylobacter	1	0	108	42	1.341919570074828	N.S.
Catabacter	Catabacter	0.0981656	-1.64216	1067	2231	-1.0634253801416325	N.S.
Catenibacterium	Catenibacterium	0.438252	1.56687	3504	33	6.687735887647646	N.S.
Cellulosibacter	Cellulosibacter	1	0	12086	15763	-0.3831774432680781	N.S.
Cetobacterium	Cetobacterium	1	0	855	0	9.7414669864011465	N.S.
Christensenella	Christensenella	0.455372	1.96783	5242	5015	0.06385519771431625	N.S.
Cloacibacillus	Cloacibacillus	0.146602	2.24795	4809	442	3.4406582901023857	N.S.
Clostridium_iii	Clostridium_iii	0.107951	2.64044	47096	53657	-0.18815811637645297	N.S.
Clostridium_iv	Clostridium_iv	0.152507	0	475251	296858	0.6789148456050178	N.S.
Clostridium_sensu_stricto	Clostridium_sensu_st	0.17108500000000001	2.14216	212385	141734	0.5834926091670489	N.S.
Clostridium_xi	Clostridium_xi	0.350956	2.09229	31132	23783	0.3884532343591829	N.S.
Clostridium_xii	Clostridium_xii	1	0	0	204	-7.679480099505446	N.S.
Clostridium_xlva	Clostridium_xlva	0.0711755	1.73588	509583	626418	-0.29780799153684256	N.S.
Clostridium_xlvb	Clostridium_xlvb	0.164759	3.12098	86963	28966	1.586008022149322	N.S.
Clostridium_xviii	Clostridium_xviii	2.6105800000000005e-4	-1.7038	21148	58669	-1.4720335428081768	normal
Collinsella	Collinsella	0.155022	1.61664	60193	37654	0.6767782444721941	N.S.
Comamonas	Comamonas	1	0	6	13	-1	N.S.
Coprobacillus	Coprobacillus	0.466284	-2.02045	331	4055	-3.610802505656416	N.S.
Coprobacter	Coprobacter	0.299766	1.56085	8178	6982	0.22807749107660946	N.S.
Coprococcus	Coprococcus	0.0294349	0	101613	215051	-1.08158636354338	normal
Corynebacterium	Corynebacterium	1	0	75	60	0.31719017588069853	N.S.
Defluviitalea	Defluviitalea	0.152051	-1.5323	2330	2842	-0.2864650945486602	N.S.
Deinococcus	Deinococcus	0.11946	1.78164	4104	4572	-0.15575869714179724	N.S.
Dendrosporobacter	Dendrosporobacter	1	0	5766	47385	-3.038567956216136	N.S.
Desulfitibacter	Desulfitibacter	1	0	76	191	-1.318175960026255	N.S.
Desulfomicrobium	Desulfomicrobium	1	0	0	2546	-11.314583244274194	N.S.
Desulfonatronovibrio	Desulfonatronovibrio	1	0	257	312	-0.27879159150936417	N.S.
Desulfotomaculum	Desulfotomaculum	1	0	298	335	-0.168315748580655	N.S.
Desulfovibrio	Desulfovibrio	0.32067399999999996	2.00997	46318	12640	1.8734935104587187	N.S.
Dethiobacter	Dethiobacter	1	0	2105	6404	-1.6046931342032913	N.S.
Dethiosulfatibacter	Dethiosulfatibacter	0.43888499999999997	-1.25788	318	895	-1.4899423082927346	N.S.
Dialister	Dialister	0.0710811	0	33393	419528	-3.651109722848876	N.S.
Dorea	Dorea	0.130001	2.94087	163595	100992	0.6958821733843124	N.S.
Dysgonomonas	Dysgonomonas	1	0	5	0	2.584962500721156	N.S.
Eggerthella	Eggerthella	1	0	11701	6053	0.9507945429917548	N.S.
Eggerthia	Eggerthia	0.00489608	-1.03807	34	552	-3.9818526532897414	normal
Eikenella	Eikenella	1	0	47	0	5.584962500721156	N.S.
Eisenbergiella	Eisenbergiella	0.0649607	-1.97087	5418	8100	-0.5800733603786252	N.S.
Enterococcus	Enterococcus	0.29079	1.86554	11531	49608	-2.104959134261522	N.S.
Enterorhabdus	Enterorhabdus	0.417877	0	1531	4479	-1.5480824350200102	N.S.
Erysipelotrichaceae_incertae_sedis	Erysipelotrichaceae_	1	0	4636	2723	0.7674650233624529	N.S.
Escherichia_shigella	Escherichia_shigella	0.418687	3.37069	212577	50761	2.066171481081742	N.S.
Ethanoligenens	Ethanoligenens	0.119872	-2.45631	1088	11048	-3.3428399439039875	N.S.
Eubacterium	Eubacterium	0.0851907	0	275364	394546	-0.5188519712401458	N.S.
Faecalibacterium	Faecalibacterium	1	0	1490324	1835836	-0.30081099248561927	N.S.
Faecalicoccus	Faecalicoccus	1	0	598	225	1.4062332303735978	N.S.
Faecalitalea	Faecalitalea	1	0	0	213	-7.7414669864011465	N.S.
Filifactor	Filifactor	1	0	122	22	2.418952549282227	N.S.
Finegoldia	Finegoldia	1	0	37	25	0.5474877953024935	N.S.
Flaviflexus	Flaviflexus	1	0	0	13	-3.807354922057604	N.S.
Flavonifractor	Flavonifractor	0.237228	2.58765	47799	52065	-0.12333095691411877	N.S.
Fusibacter	Fusibacter	1	0	84	219	-1.3719687773869582	N.S.
Fusicatenibacter	Fusicatenibacter	1	0	126457	120928	0.06449804884931964	N.S.
Fusobacterium	Fusobacterium	5.24466e-4	4.8155	5336230	32283	7.3688579702866654	carcinoma
Gemella	Gemella	0.109899	1.06343	804	233	1.7824802534185746	N.S.
Gemmiger	Gemmiger	1	0	230448	228902	0.009711136360753159	N.S.
Geosporobacter	Geosporobacter	0.350956	-3.85402	20509	335050	-4.0299813160936875	N.S.
Gordonibacter	Gordonibacter	1	0	2297	2016	0.1881677140331508	N.S.
Gracilibacter	Gracilibacter	0.28025599999999995	-1.83415	1656	4541	-1.4547541034854365	N.S.
Granulicatella	Granulicatella	0.37238099999999996	1.53777	1782	989	0.8488062726580221	N.S.
Guggenheimella	Guggenheimella	1	0	11	3148	-8.035715541414254	N.S.
Haemophilus	Haemophilus	1	0	14059	37584	-1.4185604094250177	N.S.
Haloplasma	Haloplasma	0.306658	-1.64554	1603	2416	-0.5915433313106622	N.S.
Helicobacter	Helicobacter	1	0	25	81	-1.657112286476992	N.S.
Herbaspirillum	Herbaspirillum	1	0	384	315	0.28493388740516146	N.S.
Hespellia	Hespellia	0.201639	0	1184	9094	-2.9401865787532273	N.S.
Holdemanella	Holdemanella	8.79811e-6	-2.85508	0	41537	-15.342144133537872	normal
Holdemania	Holdemania	0.350956	-1.79716	2505	3557	-0.5056800959452996	N.S.
Howardella	Howardella	0.28927499999999995	-1.78356	2434	4279	-0.8136890243188049	N.S.
Hungatella	Hungatella	1	0	30806	38653	-0.327359516193523	N.S.
Hydrogenibacillus	Hydrogenibacillus	1	0	4163	7031	-0.7559650018439878	N.S.
Hydrogenispora	Hydrogenispora	1	0	64	169	-1.3870231231092474	N.S.
Hydrogenoanaerobacterium	Hydrogenoanaerobacte	0.205904	-1.68229	6043	13716	-1.1823894233021388	N.S.
Insolitispirillum	Insolitispirillum	1	0	0	8453	-13.045418397030792	N.S.
Intestinibacter	Intestinibacter	0.221135	2.42236	70078	53900	0.3786701495191185	N.S.
Intestinimonas	Intestinimonas	1	0	25417	32073	-0.33555376859334096	N.S.
Lachnoanaerobaculum	Lachnoanaerobaculum	1	0	27	0	4.807354922057604	N.S.
Lachnobacterium	Lachnobacterium	0.350956	-3.23031	22735	134341	-2.5628600473231735	N.S.
Lachnospira	Lachnospira	0.34060999999999997	0.508824	123	172	-0.4804319172498497	N.S.
Lachnospiracea_incertae_sedis	Lachnospiracea_incer	0.17108500000000001	3.20592	664499	557943	0.25214887131183517	N.S.
Lactivibrio	Lactivibrio	1	0	0	169	-7.409390936137702	N.S.
Lactobacillus	Lactobacillus	0.138429	1.45452	7202	3879	0.8925412518770823	N.S.
Lactococcus	Lactococcus	1	0	2476	4727	-0.932636166931168	N.S.
Lactonifactor	Lactonifactor	1	0	129814	66493	0.9651610231309071	N.S.
Leuconostoc	Leuconostoc	1	0	1618	351	2.2014556516652704	N.S.
Listeria	Listeria	0.0810235	1.32542	2200	2543	-0.2089395253927968	N.S.
Lutispora	Lutispora	1	0	6858	10125	-0.5619942285790547	N.S.
Macellibacteroides	Macellibacteroides	1	0	5	906	-7.2399962398073665	N.S.
Marvinbryantia	Marvinbryantia	1	0	419	326	0.36109869216804036	N.S.
Megasphaera	Megasphaera	0.371527	0	272	11383	-5.38196280560663	N.S.
Melghirimyces	Melghirimyces	1	0	600	1461	-1.2825064152412509	N.S.
Methanobrevibacter	Methanobrevibacter	0.152507	3.3004	76779	37664	1.0275060308542923	N.S.
Methanosphaera	Methanosphaera	1	0	5	0	2.584962500721156	N.S.
Micrococcus	Micrococcus	1	0	0	10	-3.4594316186372973	N.S.
Mobiluncus	Mobiluncus	1	0	0	29	-4.906890595608519	N.S.
Mogibacterium	Mogibacterium	0.036215000000000004	-1.00956	10149	18720	-0.8831777724953067	N.S.
Morganella	Morganella	1	0	124	5	4.380821783940931	N.S.
Moryella	Moryella	1	0	15	14	0.0931094043914813	N.S.
Murdochiella	Murdochiella	1	0	0	20	-4.392317422778761	N.S.
Murimonas	Murimonas	0.0712069	-2.54878	13364	38735	-1.535215146868497	N.S.
Natranaerovirga_hydrolytica	Natranaerovirga_hydr	1	0	175	944	-2.424738900471138	N.S.
Natranaerovirga_pectinivora	Natranaerovirga_pect	0.418635	-3.13688	4636	64767	-3.8040175633197855	N.S.
Neisseria	Neisseria	0.359819	1.62821	2917	3993	-0.45285444952608067	N.S.
Obesumbacterium	Obesumbacterium	1	0	720	542	0.4090470614364605	N.S.
Odoribacter	Odoribacter	0.254032	0	32363	81471	-1.3319143969445992	N.S.
Olsenella	Olsenella	1	0	494	776	-0.6504860734407387	N.S.
Oribacterium	Oribacterium	1	0	1839	6839	-1.8942905588288852	N.S.
Orientia	Orientia	1	0	0	7	-3	N.S.
Oscillibacter	Oscillibacter	0.350956	2.88873	303320	325898	-0.10357954089836952	N.S.
Oxalobacter	Oxalobacter	1	0	953	729	0.3860928022381316	N.S.
Oxobacter	Oxobacter	0.25388799999999995	-0.809346	131	446	-1.7597369018248648	N.S.
Papillibacter	Papillibacter	0.0930394	-2.09219	2266	8857	-1.9661966061445302	N.S.
Parabacteroides	Parabacteroides	0.237228	2.27715	449694	863280	-0.9408833932055991	N.S.
Paraeggerthella	Paraeggerthella	0.232859	0.51041	2523	869	1.5366246042464589	N.S.
Parapedobacter	Parapedobacter	1	0	0	217	-7.768184324776926	N.S.
Paraprevotella	Paraprevotella	0.0133881	3.36159	424258	369	10.16320427856209	carcinoma
Parascardovia	Parascardovia	1	0	8	18	-1.078002512001273	N.S.
Parasporobacterium	Parasporobacterium	1	0	10	16	-0.6280312226130418	N.S.
Parasutterella	Parasutterella	0.205702	2.41216	30232	52937	-0.8081795470647499	N.S.
Parvibacter	Parvibacter	0.28030999999999995	-2.41581	11677	33430	-1.5173932937665313	N.S.
Parvimonas	Parvimonas	0.08014690000000001	1.45567	1559	209	2.893084796083488	N.S.
Pediococcus	Pediococcus	1	0	376	130	1.5249977117312135	N.S.
Peptococcus	Peptococcus	0.243785	1.7859	2055	496	2.048522507631592	N.S.
Peptoniphilus	Peptoniphilus	1	0	26	65	-1.2895066171949852	N.S.
Peptostreptococcus	Peptostreptococcus	1	0	531	158	1.7423994802168332	N.S.
Phascolarctobacterium	Phascolarctobacteriu	0.27172999999999997	2.55895	484976	422503	0.19895132923016945	N.S.
Plesiomonas	Plesiomonas	0.468294	3.10139	112454	26587	2.080500643858686	N.S.
Porphyromonas	Porphyromonas	0.00139074	2.07258	5679	3808	0.5764786418287056	N.S.
Prevotella	Prevotella	0.0039037300000000002	3.21583	550321	601369	-0.12797689543121038	N.S.
Propionibacterium	Propionibacterium	1	0	187	302	-0.688585131795314	N.S.
Propionispira	Propionispira	1	0	107	737	-2.7725895038969277	N.S.
Proteiniborus	Proteiniborus	1	0	28	13	1.0506260730699677	N.S.
Proteus	Proteus	1	0	15	6	1.1926450779423958	N.S.
Pseudobacteroides	Pseudobacteroides	1	0	592	50	3.5394629525745085	N.S.
Pseudobutyrivibrio	Pseudobutyrivibrio	1	0	3853	6975	-0.8560434684812055	N.S.
Pseudoflavonifractor	Pseudoflavonifractor	1	0	27353	30830	-0.17262986881808118	N.S.
Pseudomonas	Pseudomonas	1	0	2588	3197	-0.304774973580221	N.S.
Raoultella	Raoultella	0.468294	3.2458	157944	37194	2.0862416642138673	N.S.
Rhodobacter	Rhodobacter	0.0633793	-0.892676	506	766	-0.597240830499592	N.S.
Robinsoniella	Robinsoniella	1	0	119	140	-0.23266075679027498	N.S.
Romboutsia	Romboutsia	1	0	50605	54810	-0.11515701085897234	N.S.
Roseburia	Roseburia	0.30968999999999997	3.98656	1094356	1010043	0.11566530769568573	N.S.
Rothia	Rothia	1	0	3908	894	2.1268399971376724	N.S.
Ruminococcus	Ruminococcus	0.30968999999999997	0	532559	896472	-0.7513160592478698	N.S.
Ruminococcus2	Ruminococcus2	1	0	677941	1068707	-0.6566339666952743	N.S.
Saccharibacteria_genera_incertae_sedis_Genus	Saccharibacteria_gen	1	0	177	166	0.09202913849234573	N.S.
Salimesophilobacter	Salimesophilobacter	0.0772957	-3.35559	2232	90955	-5.34811365350844	N.S.
Salinicoccus	Salinicoccus	1	0	38	53	-0.4694852833012195	N.S.
Scardovia	Scardovia	1	0	3	28	-2.857980995127572	N.S.
Selenomonas	Selenomonas	0.45706699999999995	0	894	947	-0.08299937674664015	N.S.
Senegalimassilia	Senegalimassilia	1	0	3080	6312	-1.034927068723638	N.S.
Shuttleworthia	Shuttleworthia	1	0	25	11	1.1154772174199357	N.S.
Slackia	Slackia	1	0	1033	16685	-4.012330059752909	N.S.
Solobacterium	Solobacterium	1	0	58	16	1.7951802081115025	N.S.
Spiroplasma	Spiroplasma	0.122862	0.668784	5915	31285	-2.402823260343604	N.S.
Sporobacter	Sporobacter	1	0	31551	53471	-0.7610521816832758	N.S.
Staphylococcus	Staphylococcus	0.0188384	2.07368	16556	18893	-0.1904868719437136	N.S.
Stomatobaculum	Stomatobaculum	1	0	36	0	5.20945336562895	N.S.
Streptococcus	Streptococcus	0.105753	2.80206	422962	283760	0.5758551450571581	N.S.
Streptophyta_Genus	Streptophyta_Genus	0.36959499999999995	-0.912919	4210	6997	-0.7327797890707561	N.S.
Subdoligranulum	Subdoligranulum	1	0	83928	118319	-0.49545266099499585	N.S.
Succiniclasticum	Succiniclasticum	0.32515799999999995	-0.777341	70	213	-1.5917198668964643	N.S.
Sutterella	Sutterella	0.29374399999999995	0.76065	2937	5375	-0.8716987422224793	N.S.
Syntrophococcus	Syntrophococcus	0.017627900000000002	0.876391	664	229	1.5317204794441777	carcinoma
Terrisporobacter	Terrisporobacter	0.0537709	0	1867	31372	-4.06995713134781	N.S.
Thermotalea	Thermotalea	0.41237799999999997	-2.41961	2159	11078	-2.358724450875938	N.S.
Tindallia	Tindallia	1	0	10	47	-2.1255308820838588	N.S.
Tissierella	Tissierella	1	0	0	69	-6.129283016944966	N.S.
Turicibacter	Turicibacter	1	0	9179	35806	-1.963675592371768	N.S.
Vallitalea_guaymasensis	Vallitalea_guaymasen	1	0	71	91	-0.3536369546147009	N.S.
Vallitalea_pronyensis	Vallitalea_pronyensi	0.237175	-3.07831	10696	59965	-2.486938495836707	N.S.
Vampirovibrio	Vampirovibrio	1	0	1974	126	3.958952251179662	N.S.
Varibaculum	Varibaculum	1	0	0	103	-6.700439718141092	N.S.
Variovorax	Variovorax	1	0	40	10	1.8981203859807865	N.S.
Veillonella	Veillonella	1	0	398906	63016	2.6622394601152735	N.S.
Viridibacillus	Viridibacillus	0.099232	1.26599	2960	3602	-0.2831141612492374	N.S.
Weissella	Weissella	1	0	757	0	9.566054038171092	N.S.
Yersinia	Yersinia	1	0	3628	1292	1.4888497816690798	N.S.